Laboratorij za gozdno genetiko

Oddelek za gozdno fiziologijo in genetiko
Vodja oddelka: prof. dr. Hojka Kraigher
Vodja laboratorijev: Barbara Štupar
Odgovorna oseba: Marko Bajc
Tel.: +386 1 200 78 00, Fax.: +386 1 257 35 89

Javna pooblastila

  • za vodenje postopkov odobritve in vodenje registra gozdnih semenskih objektov
  • za certifikacijo gozdnega reprodukcijskega materiala
  • za vodenje Slovenske gozdne genske banke

Organizacija laboratorija:

  • LGG1: osrednji genetski laboratorij, kjer se izvaja priprava vzorcev, ekstrakcija DNK, PCR in večina pripravljalnih postopkov
  • LGG2: DGGE/TGGE elektroforeza, barvanje gelov za ločbo nukleinskih kislin z EtBR in barvili SYBR, slikanje in manipulacija barvanih gelov na UV transiluminatorju
  • LGG3: agarozna gelska elektroforeza, RT-PCR, ABI Prism 310, računalniška obdelava in analize podatkov

Raziskovalna oprema

  • zaščitne laminarne komore
  • PCR termostati ABI GeneAmp 9700
  • kapilarni sistem za genetske analize ABI Prism 310 Genetic Analyzer
  • sistem za PCR v realnem času ABI 7500 Real Time PCR System
  • sistemi za agarozno gelsko elektroforezo Bio-Rad
  • hlajen sistem za vertikalno gelsko elektroforezo
  • DGGE/TGGE elektroforezni sistem za zaznavanje točkovnih mutacij Bio-Rad DCode
  • UV/Vis transiluminacijski sistem za zajem slike Bio-Rad GelDoc
  • homogenizator za fizično drobljenje vzorcev – tudi lesa in kosti Retsch MM301
  • programska oprema za analizo genetskih podatkov: Sequencher, MEGA5, PAUP, Mr.Bayes, Bionumerics, Arleqiun, DnaSP, PhyML, BAPS, GeoDis, ANeCA, Barrier, LAMARC, Network, idr.

Ekstrakcija DNK  v laboratoriju za gozdno genetiko.

Računalniška obdelava nukleotidnih zaporedji s programsko opremo za genetske analize.

Raziskovalna področja

  • identifikacija izvora gozdnega reprodukcijskega materiala
  • genetsko varstvo gozdov in ohranitvena genetika
  • gozdne genske banke
  • molekularna identifikacija gozdnih organizmov
  • analiza biotske raznovrstnosti
  • filogenija in filogeografija
  • populacijska genetika

Analize

  • ekstrakcija DNK/RNK iz vseh tipov bioloških vzorcev
  • PCR pomnoževanje podpisnih genskih markerjev: ITS regije rDNK, odseki CR in COI mtDNK, SSU rDNK, mikrosatelitni markerji, …
  • ugotavljanje in analiza nukleotidnega zaporedja tarčnih genskih markerjev
  • fragmentna analiza mikrosatelitnih markerjev – analize populacijske genetike in sledenja sorodstva
  • DGGE analiza strukture in raznovrstnosti bioloških združb ter sledenje sprememb združb zaradi okoljskih dejavnikov
  • specializirani v molekularni identifikaciji in analizi strukture združb mikoriznih, rizosfernih  in drugih gliv
  • filogenetske analize: ML, MP, NJ, ME in mrežne filogenetske analize MJ
  • analize demografske zgodovine populacij
  • filogeografske analize: Mantel, Nested Clade, SAMOVA, idr.

Sodelovanje in članstva

  • EUFORGEN – European Forest Genetic Resources Programme
  • EUFGIS –European Information System on Forest Genetic Resources
  • ConGRESS – Conservation Genetic Resources for Effective Species Survival
  • ECCF – European Council for Conservation of Fungi
  • SIFORGEN – Slovenian Forest Genetic Resources Programme
  • COST – European Cooperation in Science and Technology: Action ES1101 – Harmonizing Global Biodiversity Modelling

Ločevanje PCR pomnožkov z agarozno gelsko elektroforezo.

 

Nazaj

Naša spletna stran uporablja piškotke, ki se naložijo na vaš računalnik. Ali se za boljše delovanje strani strinjate z njihovo uporabo?

Več o uporabi piškotkov

Uporaba piškotkov na naši spletni strani

Pravna podlaga

Podlaga za obvestilo je spremenjeni Zakon o elektronskih komunikacijah (Uradni list št. 109/2012; v nadaljevanju ZEKom-1), ki je začel veljati v začetku leta 2013. Prinesel je nova pravila glede uporabe piškotkov in podobnih tehnologij za shranjevanje informacij ali dostop do informacij, shranjenih na računalniku ali mobilni napravi uporabnika.

Kaj so piškotki?

Piškotki so majhne datoteke, pomembne za delovanje spletnih strani, največkrat z namenom, da je uporabnikova izkušnja boljša.

Piškotek običajno vsebuje zaporedje črk in številk, ki se naloži na uporabnikov računalnik, ko ta obišče določeno spletno stran. Ob vsakem ponovnem obisku bo spletna stran pridobila podatek o naloženem piškotku in uporabnika prepoznala.

Poleg funkcije izboljšanja uporabniške izkušnje je njihov namen različen. Piškotki se lahko uporabljajo tudi za analizo vedenja ali prepoznavanje uporabnikov. Zato ločimo različne vrste piškotkov.

Vrste piškotkov, ki jih uporabljamo na tej spletni strani

Piškotki, ki jih uporabljamo na tej strani sledijo smernicam:

1. Nujno potrebni piškotki

Tovrstni piškotki omogočajo uporabo nujno potrebnih komponent za pravilno delovanje spletne strani. Brez teh piškotov servisi, ki jih želite uporabljati na tej spletni strani, ne bi delovali pravilno (npr. prijava, nakupni proces, ...).

2. Izkustveni piškotki

Tovrstni piškotki zbirajo podatke, kako se uporabniki vedejo na spletni strani z namenom izboljšanja izkustvene komponente spletne strani (npr. katere dele spletne strani obiskujejo najpogosteje). Ti piškotki ne zbirajo informacij, preko katerih bi lahko identificirali uporabnika.

3. Funkcionalni piškotki

Tovrstni piškotki omogočajo spletni strani, da si zapomni nekatere vaše nastavitve in izbire (npr. uporabniško ime, jezik, regijo) in zagotavlja napredne, personalizirane funkcije. Tovrstni piškotki lahko omogočajo sledenje vašim akcijam na spletni strani.

4. Oglasni ali ciljani piškotki

Tovrstne piškotke najpogosteje uporabljajo oglaševalska in družabna omrežja (tretje strani) z namenom, da vam prikažejo bolj ciljane oglase, omejujejo ponavljanje oglasov ali merijo učinkovitost oglaševalskih akcij. Tovrstni piškotki lahko omogočajo sledenje vašim akcijam na spletu.

Nadzor piškotkov

Za uporabo piškotkov se odločate sami. Piškotke lahko vedno odstranite in s tem odstranite vašo prepoznavnost na spletu. Prav tako večino brskalnikov lahko nastavite tako, da piškotkov ne shranjujejo.

Za informacije o možnostih posameznih brskalnikov predlagamo, da si ogledate nastavitve.

Upravljalec piškotkov

Gozdarski inštitut Slovenije