Gozdna ekologija obsega raziskave stanja in procesov v gozdnih ekosistemih. Pri tem je zajet kompleks dejavnikov, ki vplivajo na razvoj in rast gozda (orografski dejavniki, matična podlaga in tla, podnebni dejavniki, preskrba z vodo, biotski dejavniki). Rastiščni dejavniki, rastiščne razmere in rastiščne zahteve drevesnih vrst so pomembna izhodišča sonaravnega in trajnostnega gospodarjenja z gozdovi. Le dobro poznavanje gozdnih tal, matične podlage, vegetacije, sestojne klime ter hidroloških razmer omogoča opredelitev in poznavanje rastišč. Poseben poudarek je na problematiki razmerja med gozdnim in negozdnim prostorom ter neposrednim in posrednim vplivom človekovih dejavnosti na gozdne ekosisteme. Znanstveno-raziskovalno in strokovno delo področja I. ZRO se sicer prilagaja zakonodaji na področju gozda in gozdarstva, varstva okolja in ohranjanja narave, vendar bolj posredno kot neposredno, saj je le malo delovnih nalog, ki se tesno navezuje na slovensko zakonodajo (dokumenti Ministrskih konferenc o varovanju gozdov v Evropi, Direktiv o habitatih, Ženevska konvencija o onesnaženem zraku na velike daljave – LRTAP in Okvirne konvencije Združenih narodov (ZN) o spremembi podnebja in Kjotskega protokola, EU zakonodaja).
Raziskovalno delo skupine naj bi bila strokovna podlaga za gojitveno, gozdno-gospodarsko načrtovanje in prostorsko načrtovanje, ki zajema problematiko gozdnega prostora. Raziskave naj bi bile naravnane tako, da prinašajo temeljne ugotovitve za učinkovito operativno ukrepanje v gozdnem prostoru (varovanje in sanacija gozdov, gojenje v smislu vseh splošno-koristnih funkcij, presoja vplivov na gozdno okolje, varstvo gozdnih tal itd.). Zaradi onesnaženosti okolja in vpliva onesnažil na gozd je pomembna naloga skupine spremljanje stanja gozdnih ekosistemov, proučevanje različnih procesov v gozdu, vrednotenje dobljenih rezultatov ter posredovanje strokovnih ugotovitev širši javnosti.
Področja dela in nosilci področij, ki jih danes izvajamo v GEKO:
• klimatologija
• gozdna hidrologija
• fenologija
• pedologija
• prehrana gozdnega drevja
• fitocenologija, ekologija rastlin
• kroženje snovi v gozdnih ekosistemih, gozdna tla in prehrana gozdnega drevja
• laboratorijske analize tal, rastlinskega materiala in vod presoje vplivov na gozdni ekosistem
• spremljanje stanja tal in prehranjenosti drevja na 16 x 16 km mreži in intenzivno spremljanje stanja gozdnih ekosistemov na izbranih TRP;
• preučevanje naravne dediščine s poudarkom na gozdnem prostoru.
• kroženje ogljika v gozdnih ekosistemih
• gozdne združbe in gozdna tla kot ponor ogljika
• dinamično modeliranje kritičnih vnosov v gozdne ekosisteme ter njihov prostorski prikaz
• ocena kritičnih vnosov za posamezne gozdne združbe ter njihov prostorski prikaz